גידולי מוח ראשוניים אינם גידולים שכיחים ועל פי רישום הסרטן הלאומי, ב-2013 דווחו בישראל על 1054 מקרים חדשים של גידולי מוח בכלל ו-510 מקרים חדשים של גידולי מוח ממאירים. בסך הכל שכיחות גידולים ממאירים הינה כ-40% מכלל גידולי המוח הראשוניים ושכיחות גידולים מוחיים שניוניים (גרורות) הינה פי 10 יותר משכיחות גידולים ראשוניים. שכיחות גידולי מוח עלתה ב-50 השנה האחרונות מסיבה שאינה ברורה, אך נראה כי עיקר העלייה נובעת דווקא משיפור באמצעי האבחון ופחות בגלל עליה ממשית.
ברוב המקרים בהם מאובחן גידול מוחי ראשוני, אין גורם סיכון ברור אשר גרם להופעת הגידול. למעשה, גורם הסיכון הברור היחיד שנקשר ליצירת גידולים מוחיים ראשוניים הינו חשיפה לקרינה מייננת, בעיקר בגילאים צעירים. דוגמא לחשיפה כזו הינה קרינה שניתנה לטיפול בגזזת בישראל ובמקומות נוספים בעולם בעיקר בשנות החמישים ואשר קושרה להתפתחות גידוליים מוחיים שונים. יש לציין כי קרינה אלקטרומגנטית ממקורות אחרים, כגון קרינה מטלפונים סלולריים וקוויי מתח גבוה, לא הוכחה כקשורה להתפתחות גידולי מוח.
כ1-5% מגידולי המוח הראשוניים נובעים מתסמונות גנטיות המעלות את הסיכון לגידולי מוח ראשוניים. התיסמונות הגנטיות הקשורות לגידולי מוח ראשוניים הינן: נוירופיברומטוזיס, תסמונת לי פרומני, תסמונת טורקוט ועוד. יש לציין כי קיימים מקרים בהם מופיעים גידולי מוח במספר בני משפחה, ללא זיהוי של תסמונת מוכרת או הפרעה גנטית ידועה, אך אלו מקרים נדירים למדי.